我覺得這個問題可以思考一下HTML文件結構的呈現，如果我沒記錯的話HTML文件是以直譯的方式被瀏覽器所解譯，所以當你
執行的指令碼區塊，
是放置在整個文件的頂端時，瀏覽器讀到該指令碼就執行了，此時頁面都還沒 load 完，所以當然是一片空白。
我剛也再度確認過，你呼叫的 Response.Write() 方法，會在 Postback 後，直接輸出於HTML文件最頂端，如下：
===
<script language='javascript'>alert('以 Response.Write() 方法輸出指令碼區塊。')</script>
<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">
<head><title>
Hunterpo Development Lab.
</title></head>
<body>
<form name="form1" method="post" action="DebugTest.aspx" id="form1">
...
</form>
</body>
</html>
因此，為了達成你的需求，你必須在頁面 load 完後才執行跳出訊息，也就是呼叫 ChiYau 大所說的方法，在你的頁面更新完資料後，呼叫
Page.ClientScript.RegisterStartupScript() 方法(用法請參考
http://msdn.microsoft.com/zh-tw/library/z9h4dk8y(VS.80).aspx)，此方法會
將 script 加在HTML文件末端，如下：
===
<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">
<head><title>
Hunterpo Development Lab.
</title></head>
<body>
<form name="form1" method="post" action="DebugTest.aspx" id="form1">
...
<script type="text/javascript">
//<![CDATA[
alert('呼叫 Page.ClientScript.RegisterStartupScript() 方法，向 System.Web.UI.Page 物件註冊啟始指令碼。(置於呈現頁面結構末端)');//]]>
</script>
</form>
</body>
</html>
了解原理後，就知道要怎麼做了，希望對你有幫助，有錯也請指正。
小人物一枚。