Douglas, quando você faz uma migração, normalmente você restaura as bases antigas e você tem não só Work Items, mas todos os projetos, códigos, documentos, etc. Está me parecendo que ao invés de migração, foi feita uma instalação do zero.
Uma forma, não muito simples de fazer isso, é usar a API do TFS e escrever um pouco de código pra copiar os WI de um lugar pro outro. Neste blog
http://blogs.msdn.com/mab/archive/2006/10/02/Making-a-shallow-copy-of-a-single-Team-Project-from-one-server-to-another-or-the-same-server.aspx, você pode encontrar passo a passo como fazer isso.
Abraços
André Dias
Team System, Data Access, Arquitetura de Software e muito mais em http://andrediasbr.blogspot.com/