JavaScript comendo solto e pra gravar a posição de onde você arrastou pra quando vocÊ entrar denovo ele estar no mesmo local é enviado um pedido com AJAX(XmlHttpRequest) para o servidor...
Assim quando vocÊ entrar na página ela é remontada do jeito que você deixou da última vez...
Da uma olhada nos plugins do jquery e acha algum drag and drop
Leonardo Lourenço Silva