Oi Randerson,
é possível sim.
Você pode criar no seu MDB consultas de acréscimo (INSERT INTO) e de atualização (UPDATE).
O primeiro passo é atualizar os registros já existentes: você relaciona a tblOriginal com a tblBackup (pelos campos chaves) e roda a consulta de atualização.
O segundo passo é a inclusão dos novos registros: você pode fazer a inserção de todos os registros, o Access automaticamente descartará os repetidos (desde que as tabelas tenham chave-primária corretamente estabelecida).
É possível ainda criar um passo adicional (se for o caso): uma consulta de exclusão (DELETE) para apagar do backup os registros excluídos da tabela original.
Você pode colocar todas as consultas em uma macro (começando pela consulta de atualização) e dispará-la no evento que lhe for mais conveniente.