Olá Vinicius.
Cara, você mesmo respondeu sua pergunta rsrsrs.
Se existe a opção para poket pc no Visual Studio e você se sente mais a vontade com a linguagem, então não tem o que pensar.
Existem diferenças sim, mas acho que você não deve se preocupar com elas. São diferenças que acho que dependendo do que você quer fazer não vão somar nada no seu projeto.
Mesmo assim ainda acho que se você se sente a vontade com VB.NET, então é isso ai cara.
Ok?
Boa sorte!!