Oi Douglas,
isso acontece somente na sua máquina ou todos os seus colegas que utilizam o TFS também não possuem essa opção? Para todas as extensões de arquivos?
Teoricamente o TFS vai somente apresentar soluções possíveis para o conflito específico que foi criado.
As opções de Merge não aparecem? Como esta opção: "Merge changes in merge tool".
Algo que você pode fazer se estas opções não estiverem aparecendo é ativá-las para a extensão do arquivo que você está utilizando. Para isso abra as configurações do Source Control
do seu Team Project Collection (Menu: Team Project > Team Project Collection Settings > Source Control) e ai você vai ver que existem as extensões de arquivos e se eles permitem merge. Edite e ative.
Abraços!
Alan Correa Morais [MCTS - Visual Studio 2010 Team Foundation Server, Administration]