Wellington o WampServer contem um banco de dados MySql, o MyAdmin é um site contido dentro do WampServer utilizado para configurar/criar banco de dados, querys e etc...
Você pode trabalhar com o driver do MySql para .NET e efetuar seus trabalho normalmente, veja documentação oficial do MySql mostrando como conectar ao MySql com .NET:
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.1/en/connector-net-tutorials-intro.html
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