CSS IIS 6

Question

Boa tarde, estou desenvolvendo uma aplicação WEB utilizando ASP NET MVC. Porém estou com um problema em relação a formatação de estilo da aplicação (CSS). Para publicar a mesma estou utilizando IIS 6. Quando faço Debug pelo visual studio fica tudo certinho blz.. Porém quando eu subo a aplicação pro servidor e rodo ela através do servidor a página perde algumas formatações do CSS.. A maioria fica certo.. são alguns detalhes mesmo que acabam prejudicando o visual do sistema. Alguém sabe se isso é alguma configuração que tem que ser feita no IIS ?
Agradeço desde já.