Bosscoder,
1 - Clique com o botão esquerdo sobre o projeto, selecione View e escolha File System. Aparecerá as pastas padrão Program Files, Programs Folder e outros.
2 - Clique com o botão direito sobre File System on Target Machine e escolha a opção Add Special Folder, nesta opção tem como criar uma pasta customizada (Custom Folder).
3 - Crie a pasta customizada e adicione a saída do projeto a essa pasta (Project Output).
Espero ter ajudado.
Att.
Ari C. Raimundo