Dá uma olhada se você está olhando os dados da empresa correta no AX (verifique a coluna DataAreaId na tabela do banco e veja se é igual à empresa selecionada na barra superior do AX).
Falando nisso, não é aconselhável inserir dados direto no banco, prefira sempre que possível fazer pelo AX para evitar inconsistência nos dados e transações.
Muito obrigado Andressa, era isto mesmo.
Infelizmente, não consegui inserir estes dados via AX, é uma procedure muito grande que criei em SQL e roda a rotina todas as noites.
Gostaria de realizar tudo pelo AX, mas, infelizmente não tive outra saída por enquanto.