Vejo o seu problema, como a falta de um plano de manutenção.
Você precisa de tempos em tempos (isso vc deverá avaliar ao seu ambiente) fazer rotinas de atualização das estatisticas e reindexação dos indices. Exemplo, tenho em um ambiente eu sigo a seguinte estratégia:
- 2º Domingo do Mês: Reindexação/Reorganização dos Indices fragmentados;
- Semanalmente: Atualização de todas estatísticas com FULLSCAN;
Qual a minha ideia com esta rotina? Reconstruir os índices muito fragmentados ou apenas reorganiza-los, conforme for necessário, isto apenas uma vês no mês, pois é algo muito pesado para o meu ambiente. Posteriormente, ao longo da semana eu apenas atualizo
as estatísticas desses índices com FULL Scan, visando não ter uma degradação do desempenho, que é o seu caso, pois os dados sofrem mudanças e a atualização de estatística irá deixar seu índice ciente de onde estão os dados e manterá o desempenho da sua consulta.
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