Olá Thamires, tudo bem?
Sei bem o que você está passando, já passei por isso e hoje consigo customizar qualquer coisa no SharePoint, vou te passar algumas Dicas por Links.
Tenho costume de usar as "Starters MasterPages", você pode fazer o download neste link:
SP2010 - http://startermasterpages.codeplex.com/releases/view/41533
SP2013 - http://startermasterpages.codeplex.com/releases/view/97062
Uso o site abaixo para customizar via CSS os componentes nativos do SharePoint, a versão do CSS deste site é para o Sharepoint 2010
http://sharepointexperience.com/csschart/csschart.html
O Site abaixo ensina a Gerar um WSP para a Sua MasterPage, eu prefiro, pois fica organizado o seu projeto, você pode versionar via TFS o seu projeto:
http://tommdaly.wordpress.com/2011/10/22/deploying-master-pages-themes-via-a-feature-using-visual-studio-2010/
Bom, acho que este é o início, o legal das Starters MasterPages é que vem comentado o código, é botando a mão na massa que se aprende, qualquer coisa é só entrar em contato!
Abs!