Pedro,
É isto mesmo. Alguns controles complexos como os da família strip (MenuStrip, ToolStrip) ou DataGridView, etc, não dão suporte a herança via design, só via código. Isso é uma feature não implementada nesta versão do VS, não é um bug. Você terá que alterar seu controle herdado via código mesmo.
Abraços,
Francisco
OK, Computer - http://thespoke.net/blogs/fbcjunior/default.aspx