Jonathan,
Crie uma tabela na instância do SQL Server, com a mesma estrutura da tabela no Informix e faça um INSERT utilizando o linked server. Veja um exemplo abaixo:
INSERT INTO TB_NOVA_TABELA_SQL
SELECT * FROM [SEU_LINKEDSERVER].SEU_BANCO.dbo.TB_TABELA_IMFORMIX
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Durval Ramos
Microsoft Partner | MTA - SQL Server 2012
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