Vinícius,
o que se faz nesses casos, geralmente, é utilizar o método onunload do java script para abrir uma popup (através do window.open) e nessa popup chamar uma página aspx responsável pelo processamento desejado. Nessa mesma págin, você teria um window.close() para fechar a janela. Algo assim:
<body onunload="abreJanela();">
....
</body>
e na sua função java script abreJanela:
function abreJanela()
{
window.open('finaliza.aspx');
}
Ricardo Oneda
http://thespoke.net/blogs/oneda/default.aspx