Bom uma solução é diferente das demais mesmo até compartilhando bibliotecas e alguns recursos!
Então cada Projeto de Site é compilado separado e ai existem pastas por exemplo Bin, que são compartilhando dentro de um mesmo dominio para vários projetos! Assim existem pastas que por obrigação você terá que colocar o a mesma dos projetos... (bin, App_Code
etc ...)
Você pode separar eles por pastas OK! mas, nada automático igual se ta querendo ...
Fulvio Cezar Canducci Dias

