Boa tarde.
Não sei se compreendi bem seu problema, mas se o caso é que com o formulário aberto o Excel fica bloqueado, este é o comportamento padrão, uma vez que a macro do formulário está executando.
Uma alternativa é utilizar a opção "Modal = False" para permitir "desbloquear" o Excel. Porém, ainda assim o formulário em questão sempre fica em primeiro plano e também é necessário assegurar que as macros do formulário foram escritas
prevendo que a planilha de atuação pode não ser mais do arquivo atualmente ativo:
frmSeuFormulario.Show False
Abraço.
Filipe Magno