Oi Sérgio,
se o Access MDB não tem tabelas vinculadas, ou seja, se o ADO está usando um Connection direto no SQL, não haverá diferença (eventualmente, o tempo de resposta pode ter uma sutilíssima diferença às vezes a favor de um, às vezes a favor do outro, dependendo do tipo de operação).
Eu gosto mais de trabalhar com MDB, pois permite criar tabelas locais. O ADP eu uso mais como substito do Enterprise Manager quando este não está disponível.