Nativamente não, mas é possível fazer isso usando COM. O único problema é que COM só funciona em aplicações rodando em Windows, em modo OOB (fora do browser) e com elevated trust, ou seja, não
dá pra simplesmente abrir uma página web e tentar usar o scanner de lá. Abaixo há 2 links (em inglês) explicando como acessar vários recursos via COM, entre eles o scanner.
http://www.brianlagunas.com/index.php/2010/02/19/silverlight-4-accessing-system-devices-with-com-interop/
http://10rem.net/blog/2010/04/14/scanning-an-image-from-silverlight-4-using-wia-automation
Você já considerou usar a webcam ao invés do scanner? Ela vai funcionar nativamente, inclusive no browser e em Mac, além de ser mais comum o usuário ter uma webcam do que um scanner.