Olá Thiago,
Seguinte, essa versão do SqlCe, acho que é a 2.0, só aceita uma conexão por banco, a versão 3.0 aceita várias, é uma das "novidades", eu nunca passei por isso mas já li a respeito :
http://msdn2.microsoft.com/en-us/library/ayee3tzx(VS.80).aspx
No topico Storage Engine 2 item.
Abraços