Olá,
Primeiramente é importante entender o tipo de disco que está utilizando em sua VM e os recursos nelas setados. Revise se não existe nenhum processo rodando no servidor alocado no Azure e se o antivírus da Microsoft está ativo e efetuando alguma verificação
profunda.
Espero que ajude.
Vinicius Mozart || MVP - Cloud and Datacenter Management || vinicius.mozart@terra.com.br || http://www.wenz.com.br || Skype:vinicius.mozart || www.wenzcursos.com.br