Resolvi o problema citado acima da seguinte forma.
Como não estava conseguindo exportar o relatório para .pdf sem que a fonte 3of9 Barcode aparecesse no mesmo, fiz da seguinte forma:
Criei um campo no Banco do tipo IMAGE e, ao salvar o meu objeto desejado, convertia o respectivo valor uma imagem de código de barra e salva-o no banco.
Em seguida apenas atualizei a View que retornava os valores para o relatório, e agora ao invés de eu criar uma campo com a fonte 3of9 barcode eu coloquei uma imagem diretamente.
Utilizei a referência BarcodeLib, abaixo segue código utilizado para converter o valor desejado em uma imagem de código de barra:
public static byte[] GeraImgCodBarras(string valor)
{
BarcodeLib.Barcode b = new BarcodeLib.Barcode();
int W = 750;
int H = 200;
b.IncludeLabel = false;
BarcodeLib.TYPE type = BarcodeLib.TYPE.CODE39;
b.Encode(type, valor.Trim(), Color.Black, Color.White, W, H);
MemoryStream ms = new MemoryStream();
b.SaveImage(ms, BarcodeLib.SaveTypes.BMP);
return ms.ToArray();
}
É uma referência bem simples de usar e possui diversos tipos de códigos de barra para converter.