Bom dia @Matheus,
Pesquisei sobre a mensagem que você informou, e isto pode acontecer pela sua estrutura de pastas não está da seguinte maneira:
Solution Root folder
|
.sln solution file
|
Project1 folder
|
Project1.csproj (or .vbproj)
|
Project2 folder
|
Project2.csproj (or .vbproj)
.
.
.
Aparentemente o TFS é a única ferramenta que possui este tipo de Warning....
Segue referência da thread no StackOverflow (em inglês): http://stackoverflow.com/questions/934263/warning-displayed-when-adding-solution-to-team-foundation-server-2010
Espero ter ajudado,
TP.
Thiago Patrocinio
