不可解な現象の話ですので、なるべく情報は詳細に書かれた方が良いです。
「タブ」は TabControl のことで、「項目」はタブページのことでしょうか?
実行時に反映されないのは「項目の追加」だけでしょうか?
たとえば Button を同じフォームに配置した場合は、そのボタンは実行時に表示されますでしょうか?
(これは実行時に表示される画面とデザインされている画面が同じであることの確認になります。)
もちろん、ソースコードにその項目を削除するコードなんてありませんよね?
また念のため、使用されているプログラム言語と Visual Studio のバージョンも教えてください。
(ASP.NET でもないですよね?)