仮想マシンプランの変更を行いたいのですが現在仮想マシンに保存しているアプリケーションはどうなりますか?
VMのサイズ (マシン スペック) を変更する、ということですよね?
VMの再起動が発生しますが、既存のOSディスク、データ ディスクの内容はそのまま維持されるので、VMにインストール済みのアプリケーションもそのままどうさするはずです。