「色を含んだ書式設定」はできませんが、前景色=FORE_COLORの設定は(書式=FORMAT_STRINGとは別に)できます。
ただし、メジャーではなく計算されるメンバ(計算メジャー)での設定になります。
Excel 2007 のピボットテーブルなら特に設定をしなくても、
Excel Add-in for Analysis Services であれば
オプションの「書式設定」タブ > サーバー定義の書式設定 で「色」にチェックを加えると、
前景色と背景色がキューブの設定に従います(色が付きます)。