Standard Edition 以上であれば、2003 までのセットアッププロジェクトと同様のものがありますが、Express Editionには、msi を作る機能を持っていません。
...の発行で行えるのは、ClickOnce と呼ばれるユーザー権限で動作するアプリケーションとなります。
残念ですが、そのままではどうすることもできない(独自のインストーラを作るとかは別として)ので
Standard Edition 以上へアップグレードするというのが一番お手軽かと。
どうしても無償でと言うことであれば、SharpDevelop を利用するか、WiX を導入するかどちらかかなぁ...