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インターネット経由でMSDE2000に接続

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やり方はいくつかあると思います。
純粋に CSV ファイルをダウンロードさせるやり方で、アプリケーション側はダウンロードしたファイルをロードする仕組みを実装する。
もうひとつは Web サービスとしてデータをクライアント側に転送するやり方。
DataSet のバイナシリアライゼーションでクライアントに転送するなど。前者は Web サービスなど関係なく単純に HTTP でのデータのやり取りになり、後者は Web サービスを使い汎用的に利用できる。
テクノロジー的にはこんな感じなので、選択するのは kans01 さんです。
自分のやりやすいだけではなく、将来的なことを考えて設計してくださいね。