コマンド引数は、*.user ファイルに保存されていました。
このファイルの変更日時を観察することで状況を把握できました。
同一のsln の下に、VS で作ったプロジェクト（以下、a.vcproj）と、これを Intel Compiler 用に
変換した a.icproj の両方を加えていました。
構成マネージャーを使って、Solution 構成ごとに一方しかBuildされないようにしていたのですが、
ここに落とし穴がありました。
vcprojの方の引数設定を変更すると、メモリ上で設定が変わるのですがファイルには変更されません。
（つまり、IDEを再立ち上げすると反映されなくなる）
icprojも変更すると、初めて.userファイルが書き換わり、vcprojの場合も含めて引数の変更が
保存されました。
結局、Source Safe とは無関係でした。
同一 sln に 同一ソースの vcproj とicprojを入れるのは少々危険が伴うようです。
.user ファイルにまで注意が届いていませんでしたが、じゃんぬねっとさんのお陰で気づくことが
できました。ありがとうございました。
