自分で試してないのですが、 GetFileVersionInfo APIでは取得できないでしょうか?
http://msdn.microsoft.com/library/ja/default.asp?url=/library/ja/jpwinui/html/_win32_getfileversioninfo.asp
コントロールパネル云々はよく分かりませんが。。ファイルを丁寧に読み解かないとダメなんじゃないですかね。以下のページに、ファイルフォーマットが載ってますよ。
■The OpenType Font File - Microsoft Typographyhttp://www.microsoft.com/typography/otspec/otff.htm