VS2005の、プロジェクトのプロパティ画面では、無理だと思います。
ですが、構成によって発行先を変える事は、実現できます。
例えば、発行先のURLを構成で切り替える場合、次の様にしたら良いでしょう。
プロジェクトファイル(C#ならば、*.csproj)をエディタで開きます。
もしくは、プロジェクトを一度、アンロードしてから右クリックで「編集 *.csproj」を実行します。
プロパティ画面で、発行先URL を、publish\hoge にしてある場合、プロジェクトファイルに以下の記述があるはずです。
Code Snippet
<PublishUrl>publish\hoge\</PublishUrl>
これを、下記に書き替えます。
Code Snippet
<PublishUrl Condition=" '$(Configuration)' == 'Release' ">publish\release\</PublishUrl>
<PublishUrl Condition=" '$(Configuration)' == 'Debug' ">publish\debug\</PublishUrl>
ReleaseとDebugで、発行先URLが切り替わると思います。
キーワードは、「MSBuild」、「条件(Condition)」で調べてみると良いと思います。
私はMSBuildをいじり始めたばかりで、あまり詳しい事はお答えできませんが、取っ掛かりになればと思います。