補足しておきます。
Visual Studioでアプリケーションの設定を保存するhttp://dobon.net/vb/dotnet/programing/mysettings.html
はなはなはなさんが既に言われていますが、(実行ファイル名).configやuser.configというXMLファイルに保存されます。
ApplicationSettingsで出来ますが、これとてXMLファイルに書き込んでいるだけです。
意識することなく出来ればいい、ということならあてはまります。