Se pueden mover los archivos a una subcarpeta de App_code sin ningún problema, pero no podrás borrar los datasets porque dentro de los tableadapters se hace referencia a ellos.
Voy a dar por cerrada esta pregunta, ya que ha sido preguntada dentro del foro de SSRS y no tiene nada que ver con esta herramienta. Si persiste la duda, es preferible plantear la pregunta en el foro de ADO.NET (por los tableadapters y datasets) o en el
de ASP.NET (por el App_code).
