No va a funcionar eso. Lo que escribes en el <% se ejecuta en el servidor antes de servir la pagina al navegador. Asi que cuando el javascript la recibe lo que encuentra ahi es el resultado de haber llamado al metodo, no la imstruccion para
llamarlo.
Si quieres llamar dinamicamente a un metodo del servidor desde javascript, tienes que exponerlo al exterior, por ejemplo, como servicio REST, y luego invocarlo mediante AJAX.