Hola Italo Juan, básicamente deberías utilizas JasperServer para proveer el servicio que puede ser consumido desde cualquier aplicación desarrollada en .NET.
Aquí puedes encontrar un ejemplo del consumo del servicio desde JasperServer. Mientras que
en este hilo he encontrado un ejemplo para consumirlo desde ASP.NET.
Creo que esto lo deberías ver en el sitio de Jaspersoft, porque allí tendrán una respuesta más clara para tus necesidades.
Saludos
Christian Amado | Software Engineer | MCPD: Windows Phone Developer | MCTS: Silverlight Developer