Si tienes la edición Express, es un programa distinto según que sea para aplicaciones de escritorio (que seguramente es el que tienes) o para aplicaciones Web. Son dos Setup distintos, que te instalarán dos copias del VS Express (no es un módulo que te añada
más funciones sobre el VS que ya tienes).
Si quieres tenerlo todo junto en un solo visual studio, instala en lugar de la edición Express la edición Community (que también es gratuita).