App.xaml y su App.xaml.cs no es el diseño de la aplicación como tal.
Es la página de inicio que le dice a la aplicación como funcionar, es decir, se inicia app.xaml y app.xaml.cs y le indica a la aplicación cual es la primera página que verá el usuario y otros parámetros de la aplicación a iniciar antes de mostrar nada al
usuario.
Si lo que quieres es modificar la primera página que el usuario verá, debes modificar MainPage.xaml o la página que cree tu proyecto, que dependiendo de cual sea, tendrá un nombre u otro.
Puedes ver cual es la primera página que mostrará buscando la página en App.xaml.cs, mostrará algo parecido a esto en una de sus líneas: rootFrame.Navigate(typeof(PAGINAINICIAL),
Siendo PAGINAINICIAL la primera página que cargará el sistema al abrir la aplicación y la cual debes modificar.