Veamos,
Software Aassurance, es un tipo de licenciamiento tipo ALL, o sea, que puedes bajar el SQL Server, de la version que quieras, cuando quieras.
En cuanto al CLUSTER, siempre se cobra el licenciamiento de los servicios de SQL Server que esten activos (excepto, Developer y Express, que son libre de cargo).
Entonces, si tienes un FCI, activo-activo, se cobraran ambas licencias, no asi, si tienes un activo-pasivo.
¿Que version-edicion de SQL Server manejas?
IIslas Master Consultant SQL Server