Hola
Pero la instalación la puedes escoger en el mismo asistente o puedes seguir con la que otorga por defecto. En caso tu quieras saber la aplicación una vez que la instalas y dentro de ella con un botón ir a su ubicación, deberás utilizar el método:
Directory.GetCurrentDirectory ()
Saludos
Brayan De la Cruz
Lima - Perú