Revisé la documentación de ScriptControl y creo que debes de utilizar el método Eval() que permite analizar una expresión y retornar un resultado. Por otro lado, el operador de comparación '>' debería aplicarse sobre operandos numéricos y no sobre cadenas,
finalmente, creo que las variables no pueden resolverse dentro de la cadena.
Using ScriptControl Methods
Dim txtPrv As String
Dim nTotal As Double
Dim bValor As Boolean
txtPrv = "0002"
nTotal = 100000.02
ScriptControl1.Language = "VBScript"
bValor = ScriptControl1.Eval(txtPrv & "<> ""0001"" AND " & nTotal & "> 100000.01")
MsgBox (bValor)
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